最完整海洋微生物 基因數據庫出爐
來源:媒體滾動
【研究進展】
科技日報訊 (記者宋迎迎 羅雲鵬)記者從近日舉辦的“千種海洋生物基因測序項目”暨全球海洋微生物基因庫建設及應用成果聯合發佈會上獲悉,華大生命科學研究院聯合山東大學、英國東安格利亞大學等機構,構建了迄今爲止最完整的海洋微生物基因數據庫,並從中發現大量具有應用潛力的基因資源。該研究爲開發抗菌肽、新型基因編輯工具、PET塑料降解酶等提供了新思路。相關成果在線發表於國際學術期刊《自然》上。
研究團隊介紹,他們通過對已公開的海洋微生物宏基因組數據進行分析和深度挖掘,構建了海洋微生物基因數據庫GOMC。這一數據庫擁有超4.31萬個海洋微生物基因組和24.58億個基因序列,是已報道海洋基因組數據庫Tara Ocean的3倍。其中,2萬多個微生物是潛在新發現物種,近1萬個微生物爲在深海等獨特生境中首次發現。目前,該數據庫數據已存儲於國家基因庫生命大數據平臺。
論文通訊作者、青島華大基因研究院院長範廣益介紹,研究團隊通過對數據庫GOMC進行深度挖掘,發現了多項具有應用潛力的基因資源。其中,研究團隊鑑定了36個新型CRISPR-Cas9基因編輯系統,並挖掘出一個具有潛在應用價值的新型Cas9編輯系統,爲科研人員基因編輯工具使用提供了更多選擇。
據瞭解,作爲青島自貿片區“千種海洋生物基因測序項目”第一年度重要成果,該項研究將助力海洋微生物的演化、生態學研究和遺傳資源開發與利用。