政院秘書長多有權？ 吳敦義：不像有人形容那麼大
到底行政院秘書長一職，是否真像林益世所形容的那麼有權、那麼大，副總統吳敦義4日以「近身接觸2年5個月」，描述他所知道的行政院秘書長職務，吳敦義表示，的確有一個「行政院秘書長函」的公文處理形式，也確實有一個秘書長的職名章，但秘書長所核發的公文，不會是重大政策或人事案。
面對媒體詢問時吳敦義強調，他只能以事實來敘述秘書長的職務，但不能用形容詞，因爲形容詞有情感和主觀的判斷在內。他表示，自己至少曾經很近身的接觸「政院秘書長」有2年5個月的時間。
吳敦義認爲，身爲政院秘書長，一方面要看院長對他的授權，一方面還要看他對政務的熟悉、深入的程度，以及看他和各部會之間，彼此建立工作的互信跟了解。最重要的是，要建立在一個溝通協調、調和鼎鼐的角色，他必須要看學養、瞭解、協調能力，還有誠信。
而對於「二個印章」說，吳敦義也提出說明，政院秘書長有一個特別之處就是「行政院秘書長函」，這通常是經由院長覈定的事，或者內籤已確定的事，用此來代表某個層級以下的公文，就是簡化到不必用行政院函，所以他有「行政院秘書長函」，也算是公文處理形式之一；的確這個函也會有他的職名章，但是這個職名章通常都不是重大的政策、也不會是重大的人事，如果有的話，通常是經由上級已覈定，他只是用秘書長函做函覆而已。
吳敦義強調，不能講說行政院秘書長大到像有些人形容的那麼大，但是也不能忽略了這個行政院秘書長確實是一個樞紐性的工作。因爲通常各部會送到行政院的公文，在行政院內各處看完後就會送進副秘書長、秘書長、副院長，然後由院長決行，有些也許是副院長代院長決行，極少是由秘書長代理決行。
吳敦義的這番說明，雖然不帶有任何的形容詞或評論，但確實也是間接駁斥了林益世在錄音檔中，向陳啓祥宣稱他能「喬」任何事的說法。