首都在南京？教長蔣偉寧：首都很明確在臺北
針對教育部行文學校，內文用南京當作中華民國首都，事件曝光後在立院引起注意，不少立委利用質詢機會詢問各部會首長。教育部長蔣偉寧明白指出中央政府遷臺後，首都就在臺北，坦承是同仁參考過去資料出錯，會發函給各校更正。
首都到底在南京還是臺北引起立委在各委員會內爭相詢問，民進黨立委陳歐珀在外交與國防委員會向國安局長蔡得勝質詢時，詢問國安局的情搜地點有沒有包括南京？或是否要在南京維安？蔡得勝先低調地說這不是他能回答的問題，接着再說，依據憲法，中華民國主權及於大陸，南京當然是首都。
國民黨立委江啓臣則在內政委員會質詢內政部長李鴻源，詢問他首都在哪？李鴻源明白表示，憲法內沒有規定首都在哪，中央政府所在地應該視爲首都，而目前中央政府在臺北，臺北當然就是首都。
教育部長蔣偉寧在人才培育白皮書記者會後接受訪問表示，從1949年中央政府遷到臺灣至今，中央政府就在臺北，毫無疑問首都是臺北。而該公文是同仁參考過去的資料，用舊的文件解讀後產生的誤會，將主動發函給各校更正。