DeeCamp2022 結營：蛋白質組學AI大數據模型奪冠
【本站科技9月1日報道】DeeCamp2022人工智能訓練營總冠軍答辯暨結營典禮在創新工場北京總部線上舉行。經過一上午的精彩答辯，挑戰大規模蛋白質組學信息發現賽題的ProteinMiner團隊摘得DeeCamp2022總冠軍的榮譽，另外五支隊伍獲得優勝獎。
記者獲悉，DeeCamp人工智能訓練營是創新工場發起的一項面向全球大學生的公益項目，專注培養應用型AI人才，迄今已經舉辦六屆。DeeCamp2022的主題是“用AI探索生命科學新邊界”，由創新工場和清華大學智能產業研究院（AIR）聯合主辦，來自全球各個地區頂尖高校的計算機、生命科學等專業的150位學員自發組成30支隊伍，經過兩個月的課程學習和項目實踐，最終共六支隊伍入圍最終答辯環節。
創新工場董事長兼CEO李開復、清華⼤學智能產業研究院（AIR）院長張亞勤、沙特阿卜杜拉國王科技大學終身正教授兼中國人民大學高瓴人工智能學院訪問講座教授高欣、深圳灣實驗室系統與物理生物學所資深研究員周耀旗、清華大學智能產業研究院副院長劉洋、清華大學智能產業研究院（AIR）首席研究員聶再清、中國人民大學數學科學研究員龔新奇、創新工場執行董事兼前沿科技基金總經理任博冰擔任評委並出席了結營典禮。
創新工場董事長兼CEO、HICOOL商學院榮譽院長李開復博士表示，AI＋科學交叉是創新工場預測未來5到10年間會引爆的創新增長新範式，AI＋生命科學更是造福人類、影響深遠的黃金賽道。這也是6年來一貫倡導“學以致用”的DeeCamp首次聚焦AI＋生命科學這一命題的深意所在。這次入圍總決賽的6支團隊都是由AI和生命科學相關專業的優秀同學組成，在頂尖科研、產業導師指導下，在蛋白質結構預測、全基因組表達預測等各種場景進行探索，挑戰了多個真實世界的難題。很高興決賽同學在這次大賽中脫穎而出，期待在不久的將來，成爲中國“AI＋生命科學”賽道的創新先鋒。我期許有志創業的DeeCamp同學，也可以把這次的項目實踐視爲產業價值的初步探索，同時關注幫助高科技創業者的北京HICOOL創業大賽及HICOOL商學院的豐富資源。
DeeCamp2022聯合主辦方、清華大學智能產業研究院（AIR）院長張亞勤院士表示：“生命科學與生物醫藥領域正在步入數字化3.0時代，以人工智能和數據驅動的第四科學研究範式，將輔助人類探索並解決生命健康的問題，加速生命健康與生物醫藥領域向着更快速、更精準、更安全、更普惠的方向穩步發展。這既是AI for Science的重大機遇，同時也將造福全人類。我很高興做爲本次DeeCamp導師和評委，過去兩個多月，我看到同學們在“AI+生命科學”的大命題下，積極探索AI與生命科學的交叉發展之路，也都取得了不錯的成果。最後，再次祝賀冠軍團隊，也希望同學們都學有所成，滿載而歸！”
在整個上午的精彩答辯後，創新工場董事長兼CEO李開復博士對六支入圍隊伍表示了肯定：“本次大賽中，同學們都有令人驚豔的表現，特別是在短短的一個月時間就圍繞創新的課題獲得出色的成果。創新工場非常關注生物計算的發展，已經圍繞‘AI＋遺傳中心法則’方面孵化了多家公司，包括AI+基因編輯、AI+蛋白、AI+RNA等。本屆DeeCamp同學們的表現讓創新工場對這些前沿領域的創新突破充滿了期待，期待新世代AI+生命科學的人才投入，爲未來生物計算帶來更多驚喜。”
清華⼤學智能產業研究院（AIR）院長張亞勤院士表示，很高興繼續和創新工場聯合主辦本屆DeeCamp。生命科學領域步入數字化3.0時代，DeeCamp2022聚焦AI+生命科學，不僅代表了當下整個科學界的研究趨勢，也代表了中國的科技和產業發展趨勢。AI與數據賦能的全新的科學範式，不僅會提高科學研究的效率，也將會造福整個人類社會。
隨後，張亞勤院士公佈了DeeCamp2022總冠軍榮譽的歸屬。挑戰大規模蛋白質組學信息發現賽題的ProteinMiner團隊，成爲本屆DeeCamp的年度冠軍團隊。
DeeCamp2022冠軍團隊介紹：
蛋白質是生命活動的真正承擔者。獲取蛋白質的序列和結構信息，對於疾病的研究、藥物的研發尤爲重要。質譜作爲一種生物表徵儀器，在蛋白質測序領域有着支配性的地位。但面對大規模的未知序列蛋白，現有的質譜從頭測序技術仍面臨精度低的問題，而這是推動新抗原發現驅動的個性化免疫療法亟待解決的難題。
ProteinMiner立足於AI與大數據驅動的蛋白質的質譜測序技術，致力於提升大規模地發現未知的蛋白序列與結構信息的能力。ProteinMiner首次提出預訓練的AI譜圖語言大模型，提升質譜從頭測序的精度，加速免疫相關的新抗原/抗體的發現，以推動個性化免疫治療的進程。此外，ProteinMiner提出譜圖分類深度模型，實現快速的交聯質譜數據的鑑定，構建實驗數據支撐的組學規模的蛋白質空間距離信息數據庫。
ProteinMiner團隊的組建來源於大家多次合作的信任，隊長毛鵬志是中科院計算所計算蛋白質組學/信息檢索方向的博士生，隊員還包括香港中文大學(深圳)計算機視覺碩博生葉崇傑、中科院計算所生物信息學博士生齊曉寧、香港中文大學(深圳)數據科學與大數據技術專業本科生薛浩楠。
奪冠後，隊長毛鵬志表示，很感謝DeeCamp2022提供的資源和平臺，讓自己能夠找到志同道合的成員們，把自己的想法落地爲實踐，有機會取得學術和應用場景的突破。“一切纔剛剛開始。這次奪冠是我們取得的小的里程碑，我們會繼續堅持做下去，希望能夠做出對學術界有影響，幫助產業界降本增效，帶來實際的效益的產品。這條路還有很遠，非常感謝和珍惜DeeCamp爲我們提供了啓動資金。”
毛鵬志與團隊成員葉崇傑都是第二次參加DeeCamp，去年他們也曾在一個團隊並肩奮鬥，雖然鎩羽而歸但反而激發再次參賽的鬥志。葉崇傑說，“第二次參加DeeCamp，是出於對DeeCamp和組委會的信任，也是由於對夥伴的信賴。我和鵬志有共同的願景，我也相信他的能力和責任心，能夠帶領我們取得成功。”
值得一提的是，隊伍裡的薛浩楠同學，剛剛升入本科三年級的學習。被問到參與科研高手雲集的DeeCamp2022的感受時，他表示，自己非常珍惜DeeCamp提供的機會，不僅能夠深度體驗技術落地與功能實現，還能夠一窺生物信息這個當下最前沿的技術領域。這些都是自己在課堂上難以一線接觸到業界前沿技術＋產業實踐的機會，未來自己也有志繼續在工程領域繼續探索和成長。
另外五支入圍總決賽的隊伍獲得了優勝獎。